研究人员开发新方法确定非法交易的黑猩猩来源

据《细胞基因组学》杂志今天（2022年6月1日）报道，科学家们制作了第一个野生濒危黑猩猩的基因组多样性目录。该目录包括来自其整个范围的828个黑猩猩样本，提供了黑猩猩种群结构和隔离、迁移和连接的精细模式的详细重建。研究人员利用这些信息设计了一种方法，将没收的黑猩猩与它们在大约100公里范围内的来源地联系起来，目的是支持打击黑猩猩和相关产品的非法贸易的努力。

研究人员说，如果没有泛非计划（PanAf）在48个地点对成千上万的黑猩猩粪便样本进行协调采样，以及多年来为开发有效检索和富集粪便样本中宿主DNA比例方法策略所做的努力，这项工作是不可能的。粪便样本伴随着许多技术挑战，因为它们只包含少量的退化黑猩猩DNA，但它们也有研究濒危物种的优势，因为它们可以在对动物干扰最小的情况下进行广泛的收集。这些方法现在可以被用于研究许多其他濒危灵长类动物和其他物种。

由于黑猩猩的化石记录和古DNA是有限的，重建其过去的唯一方法是通过对活体的研究。科学家们承认有四个黑猩猩亚种，但对它们之间的关系一直存在疑问。关于这些亚种之间有多大的联系，一直是一个长期的问题。为了在新的研究中探索这些问题，研究人员从目前整个黑猩猩分布区的800多个非侵入式收集的野生黑猩猩粪便样本中检索了部分基因组信息。他们把注意力集中在21号染色体上，这是黑猩猩基因组中最小的连续核序列，也是用于推断黑猩猩种群结构的大量基因组序列数据的来源。

研究人员在21号染色体上发现了比以前的研究多50%左右的、新的遗传变体。相关数据集已经成为了解黑猩猩之间最近和过去基因流动的关键。此外，它还使我们能够描述种群最近是否被隔离，或者是否有一个历史事件造成的隔离。通过描述每个社区或种群的基因组特征，研究人员还创建了一张地图，将基因组信息与地理位置联系在一起，以便研究人员能够了解每个种群的情况。