维州“基因侦探”利用基因组指纹技术追踪新冠起源
由于COVID-19冠状病毒经常突变,墨尔本大学Doherty研究所的研究人员与维州卫生部门合作,使用一种被称为基因组测序的技术,自一月下旬以来通过不断采集维州COVID-19感染病例的DNA,追踪集群感染源头和传播链。
这项世界领先的基因组指纹技术也在新西兰和澳大利亚其他州使用,目前维州80%感染病例的DNA已被采集。
Doherty研究所五年前开发了基因组计划,追踪多种病毒的基因组序列,在全球建立数据库。
Doherty的医学微生物学家Norelle Sherry博士表示,该技术通过利用病毒的“指纹”,追踪感染的先后顺序,绘制出一个连接所有病例的“地图”。研究人员可将这些数据与全球数据库进行比较,从而追溯新病例感染源头。
结果显示,尽管在疫情初期病毒簇数高达76个,但大多数是“终端簇”,没有继续传播。表示社交隔离措施有效地抑制了病毒的传播。
该技术的研究成果目前已得到社会各界人士的肯定,预计很快将作为学术论文发表。
据悉,维州本周三打破了自4月7日以来的最高单日增幅纪录,迫使采集工作大幅增加。
建立基因组数据模型的生物信息数学家也一直在观察病毒的基因组特征,防止漏查个别病毒信息。
据了解,维州COVID-19病毒基因组测序覆盖率全面程度处于世界领先水平。